kelas khusus yamaha merupakan kelas TBSM yang mengalami sinkronisasi dengan dunia industri dalam hal ini adalah P.T Yamaha sebagai salah satu vendor perusahaan otomotif terkemuka di Indonesia bahkan di dunia.
sinkronisasi ini bertujuan untuk menyelarasakan kurikulum industri yang di miliki oleh Yamaha dengan kurikulum yang dimiliki oleh SMK Muhammadiyah 04 Boyolali.
dalam kelas khusus Yamaha ini tidak hanya sekedar menjadikan siswa berprestasi dengan akademik namun juga didik dengan pendidikan karakter sehingga siswa bisa mendapatkan keseimbangan dalam akademik dan karakter untuk menunjang hasil yang maksimal .